第8話「京都地下水脈の謎」
金属加工工場の社長・向井浩（浅田祐二）の遺体が石段の下で見つかった。打撲痕から転落事故のようにも見えたが、手のひらがまったく汚れておらず、マリコ（沢口靖子）は不審を抱く。
規制線の外に出たとき、野次馬の中から「榊師匠！」とマリコを呼ぶ声が…！ 声の主は、解剖医・風丘早月（若村麻由美）の娘・亜矢（染野有来）で、マリコを“師匠”として慕う彼女は医大を卒業し現在、近くの病院で研修医として勤務しているという。
その後、頭部の打撲痕が現場の階段とは一致せず、向井の下足痕が現場にひとつも残されていなかったことが判明。どこかで殺害され遺体を遺棄された可能性が浮上する。
工場では前夜、新入社員・松井陸（羽谷勝太）らの歓迎会が開かれたが、向井は急用ができたと言って欠席していたことが判明。工場長・林健一（大堀こういち）によると向井は最近、近所の草木染職人・椛山卓司（片桐仁）や病院事務長・須黒正明（肥後克広）ともめていたことがわかる。向井の工場では冷却水用に井戸を掘ったのだが、その影響なのか草木染工房と病院、それぞれが使っていた井戸の水質が変わり、苦情が寄せられたという。
土門薫（内藤剛志）が事情を聴くと、椛山は死亡推定時刻、染液の調合をしていたと話すが、弟子の長谷部拓海（庄司浩平）によれば、そのアリバイは嘘だった。また、須黒のもとも訪ねるが、彼のアリバイを証明したのは奇しくも亜矢で…。
第1話 2024年7月3日「 新生科捜研に衝撃！マリコVS死を呼ぶキス…姿なき犯人の空飛ぶ1000の分身と猫の謎」
第2話 2024年7月10日「科学が解明!! 超美味ラーメン隠し味の涙」
第3話 2024年7月17日「甘い香りの逃亡者」
第4話 2024年7月24日「売れない家の秘密」
第5話 2024年7月31日「密室と甘い焼き芋」
第6話 2024年8月14日「天才少女と母の嘘」
第7話 2024年8月21日「太陽になりたい男」
第9話 2024年9月4日「女たちの最終決戦」
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