最愛の妹・喜多見涼香（佐藤栞里）を亡くし、失意のどん底にいた喜多見幸太（鈴木亮平）はMER脱退を告げる。都知事の赤塚梓（石田ゆり子）は意識不明のまま生死の境をさまよっていた。そして、音羽尚（賀来賢人）は大物政治家・天沼夕源（桂文珍）に逆らえないまま、遂にMER解散が決定しようとしていた…。
そんな中、エリオット・椿（城田優）による連続爆破テロで東京中が炎上！多くの負傷者が出るが、喜多見も音羽も出動せず、ERカーの使用も禁じられてしまう！
最大のピンチを迎えたメンバー。しかし、その時…喜多見の心を震わせる「言葉」が響いた。
TOKYO MERの最後の出動の物語。
第1話 2021年7月4日「走る手術室!! 全ての命を守るため…危険に挑む救命チーム誕生」
第2話 2021年7月11日「医者なら全力で命を救え！研修医の試練」
第3話 2021年7月18日「立てこもり事件発生病の人質少女を救え」
第4話 2021年7月25日「トンネル崩落！心臓移植へ命のリレー！」
第5話 2021年8月1日「エレベーター火災！決死のオペで閉じ込められた妊婦を救え！」
第6話 2021年8月8日「山中で謎の失踪事件メンバーに命の危機…絆を引き裂く亀裂！」
第7話 2021年8月15日「新たな敵は巨大警察組織−謎の爆破予告から弱き人々を救え！」
第8話 2021年8月22日「医療機器が全停止！危機に臨むチームの絆を裂く禁断の過去…」
第9話 2021年8月29日「大使館で命の危機！突入すれば国際問題…迫られる究極の選択」
第10話 2021年9月5日「最終章−非情テロで遂に死者が…誰よりも守りたい人」
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