警察で取り調べを受ける武智（田辺誠一）は、無実を訴え呟く。「僕は何も悪くない…」。
しかし、既に世間ではSNSの人間によって解析された武智の殺人疑惑の証拠となる動画が拡散され、武智の悪事を暴いたものたちの勝利宣言で溢れかえっていた。
ついに澪奈の死の原因となったフェイク動画の真相にたどり着いたと思う3年A組の生徒たちは未だ解放されない理由を一颯（菅田将暉）に問う。すると一颯は澪奈の死の原因はこれがすべてではないと告げ、むしろこれからが「本番」であると突きつける。戸惑う生徒たちに一颯が与えた次なる課題は……「自習」。回収していた鞄や携帯電話を返却し、今日1日を思い思いに過ごすようにと告げる。
一方、郡司（椎名桔平）は、一颯の真の目的を突き止めるため、文香（土村芳）を訪ねる。郡司は文香の話から、武智の背後にいる人物が誰なのかを知る。捜査が進み、武智が澪奈を殺害した犯人という証拠が固まっていく。武智はまもなく自供すると思われたが……。そして、自習を進める教室の中、瑠奈（森七菜）が武智の動画を見返していると、とある驚愕の事実に気付いてしまう――。
この物語の「本番」が始まる。真の謎、真に伝えること、その行く先とは――。衝撃的第8話が幕を開ける。
第1話 2019年1月6日「衝撃的ミステリー！教師が生徒29人を人質に！ある生徒の死の真相!?最後の授業開幕」
第2話 2019年1月13日「新事実発覚！死に追い込んだ同級生の罪」
第3話 2019年1月20日「衝撃の急展開！共犯者判明！戦慄の教室」
第4話 2019年1月27日「黒幕はアイツ！広がる闇。物語は核心へ」
第5話 2019年2月3日「第1部完結！全生徒逃走!?決断の1時間」
第6話 2019年2月10日「怒涛のヒーロー編！開幕！黒幕教師は誰」
第7話 2019年2月17日「糾弾の時！犯人教師と対決！真相繋がる」
第9話 2019年3月3日「最終章！最後の授業全ての謎が繋がる日」
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