ある日、稲見（小栗 旬）や田丸（西島秀俊）が所属する特捜班は、大学で航空宇宙学を専攻する有馬丈博教授（小市慢太郎）の身辺警護を命じられる。
しかし、有馬に関する詳しい情報は与えられず、分かっているのは、すぐにでも命を狙われるような危機的状況にあり、一週間後に出国するということだけ。大学の研究室を訪れた特捜班に対して、横柄な態度で接する有馬。
同じ頃、大学の構内には護衛のついた有馬を険しい表情で見つめる石黒（近藤公園）の姿があった――。
翌朝、有馬とともに大学へ到着した稲見は、研究室付近で何やら不穏な空気を感じる。
すると、樫井（野間口徹）が爆薬の臭いを嗅ぎつけ、研究室内に爆弾が仕掛けられていると察知。注意を促すが、有馬はそれを無視して部屋のドアを開けてしまい、その瞬間、激しい爆音とともに研究室は破壊されてしまう。
現場近くのエレベーターホールでは、拳銃を手に待ち構える石黒の姿が。その裏をかいて、なんとか建物の外に脱出した3人。
しかし、向かった駐車場には、もう一人の暗殺者・石立（浜田学）が潜んでいて、稲見は石立と激しい攻防を繰り広げる。
事態を受けて、吉永（田中哲司）は鍛治（長塚京三）に今回の任務の背景を問い詰める。鍛治はミサイル実験に力を入れるある国が、有馬の優秀な頭脳を狙って拉致を画策していると明かすが、吉永は腑（ふ）に落ちない。暗殺者を割り出すため、大山（新木優子）は前科者リストをチェックするが、稲見は「あいつらは前科者とか、そういった種類の人間じゃない」と、男たちが暗殺のプロだと確信していて――。
第1話 2017年4月11日「巨悪に規格外なチームが挑む!」
第2話 2017年4月18日「暗殺の真相を暴け」
第3話 2017年4月25日「国会議員襲撃!平成維新軍の脅威」
第5話 2017年5月9日「危険な潜入捜査!本当の正義とは」
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