早朝、京都市内の河原でデザイナーの深瀬麻未（篠原真衣）の絞殺死体が発見された。麻未は元モデルで、人気ミステリー作家・公彦（井之上チャル）を夫に持つ有名人だった。
検視に当たった榊マリコ（沢口靖子）は、解剖医・風丘早月（若村麻由美）の待つ洛北医大に遺体を搬送。解剖に立ち会うため路線バスに乗ったところ、なんと猟銃を持った男に乗っ取られてしまう。マリコを含めた乗客の男女5人と運転手、あわせて6人が人質になってしまった。
だが、バスジャック犯が携帯電話を没収するため乗客の所持品をあさった際、荷物の間からひと粒のターコイズが転がってきたため、マリコは驚愕する。実は、麻未の殺害現場にはちぎれたターコイズのネックレスが落ちていたのだ。このターコイズが意味するのは、バスの中に麻未を殺害した犯人がいるという事実にほかならない…。
そんなとき、マリコはバスジャック犯の着衣に、殺害現場の河原に生えていた雑草の種子が付着していることに気づく。このバスジャック犯こそが、麻未を殺した人物なのか…!? マリコは揺れでバランスが崩れたふりをして、バスジャック犯に接近するが…!?
一方、マリコの身を案じる土門刑事（内藤剛志）と科捜研のメンバーは、必死にバスの行方を捜索していた。バスジャック犯から何の要求もないことも、また不気味さを増していた。一方で、車内では乗客に対し、バスジャック犯が奇妙な質問を始める…。バスはいったいどこに行こうとしているのか、犯人の目的は何なのか…!? すべてがわからず、残されたメンバーは焦るが…!? はたしてマリコは無事、助かるのか…!? そして、殺人犯は誰なのか…!?
第1話 2016年10月20日「美女誘拐！覆面犯を透視する０．２秒の微表情解析!!」
第2話 2016年11月3日「新幹線急加速…決死の人質救出作戦!!空飛ぶ巫女の謎」
第3話 2016年11月10日「夫婦問題カウンセラー殺人！死体が破いた離婚届の謎」
第4話 2016年11月17日「マリコ決死のヤミ鍋鑑定！誕生日に殺された美女の謎」
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第6話 2016年12月1日「京都職人技殺人！血が付かない和傘VS電気仕掛けの女」
第7話 2016年12月8日「マリコVS爆弾配達人〜“八ッ橋”が暴いた暗号文の謎」
第8話 2016年12月15日「さらば科捜研！絶対止まらない爆弾の罠…衝撃ラスト」
正月スペシャル 2017年1月3日（火）「列島大追跡！マリコｖｓ誘拐殺人犯〜24年前の未解決事件が今また動き出す!!刑事を狙う自動走行バイクと空飛ぶ身代金3000万円の謎を飛行機雲が解く！」
第9話 2017年1月12日「マリコｖｓ疑惑の女医“禁じられた解剖”と高血糖の謎」
第10話 2017年1月19日「嘘に殺された美女！脳科学が暴く人気モデルの裏の顔」
第11話 2017年1月26日「グルメ格付け殺人！死を呼ぶ裏メニューで人間発火!?」
第12話 2017年2月2日「マリコｖｓ京都花街の女！舞妓の仮装行列を透視鑑定!?」
第13話 2017年2月9日「マリコｖｓ似顔絵捜査官！顔が上下逆になる殺人犯の謎」
第14話 2017年2月16日「マリコｖｓ超常現象を呼ぶ女!?空飛ぶタイヤと密室の謎」
第15話 2017年2月23日「雪山カップルを狙う銃弾！５℃以下で白く光る美女!?」
最終話 2017年3月9日「最終鑑定…完全密室の罠に落ちたマリコ!!衝撃ラスト」
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