流田縁（香取慎吾）が無くしている記憶の間に、何が起こっていたかは意識が戻った千代田真紀（鈴木保奈美）や藤春獏人（袴田吉彦）の証言で徐々に埋まりつつある。しかし、縁は自分自身の記憶が全く戻らないことに焦っていた。特に、藤春には永友エミリ（倉科カナ）から預かった物があるはずだと言われたのだが、縁には思い出す事が出来ないのだ。
真紀が科捜研に復帰すると、警察から一ノ瀬栄造教授（柴俊夫）の自殺に関する再調査の依頼が来る。それは、柏木夏生刑事（谷原章介）が手配したものだった。そんな研究所に、一ノ瀬の妻、鈴子（大谷直子）が訪ねて来た。実は、鈴子も当時、警察に再捜査を依頼したのだが、遺書があったため拒否されていたのだ。縁は一ノ瀬が自殺した長野のホテルへ。松井丈太郎（中山優馬）や田坂繁（イッセー尾形）たちは科捜研で実況見分書や鈴子から預かった遺書の内容を調べ始める。
一方、柏木たちは一ノ瀬研究室のメンバーで、行方不明となっている大島隆二（橋野純平）を追い始める。藤春は、大島が一ノ瀬研究室に出資していたバーベル社に拉致されたと証言していた。柏木は、妻の英美（中込佐知子）から大島が見つかった時の身分確認用に、本人の持ち物を預かる。
そんな時、石巻桜子（西内まりや）は身の回りに不審を感じて、真紀や柏木に相談。それは誰かに見られている気配だった。しかも、桜子が気配を感じるのは、くるみ（濱田ここね）と一緒にいる時で…
第1話 2014年4月9日「売るのは決定的証拠科学捜査と人の想いで弱者救う民間科捜研」
第2話 2014年4月16日「強盗か怨恨か？防犯カメラが暴く真実！？」
第3話 2014年4月23日「暴かれる過去の秘密亡き恋人の裏の顔…」
第4話 2014年4月30日「甦る過去と因縁！？遂に新たな犠牲者が」
第5話 2014年5月7日「チーム解散！？仲間が残した謎の証拠品？」
第6話 2014年5月14日「謎の女が仕掛けた罠亡き恋人からの伝言」
第7話 2014年5月21日「哀しき過去との対峙 謎の天才科学者の影」
第8話 2014年5月28日「事件は遂に核心へ！容疑者の意外な出生？服役囚が隠す呪われた研究とは？」
第9話 2014年6月4日「目覚めた仲間が語る真実と埋まりゆく記憶 禁断の研究と不可解な死の謎とは」
最終話 2014年6月18日「真実には続きが！？衝撃の結末と罪の記憶 届けられた恋人の最期の言葉とは」
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