最終回2時間スペシャル「プロテクト」
ラテ欄「プロテクト〜甲斐享撃たれる！亡き小野田官房長が極秘に進めた計画とは！？」
闇社会の大物・御影康次郎（中村嘉葎雄）の死刑が確定した。有罪の決め手になったのは、彼の三男・智三（冨田佳輔）の証言だった。出所したばかりの長男・真一（阿部進之介）と弁護士の次男・悠二（篠田光亮）は、父親を裏切った弟・智三が許せないため探そうとするが、どうしても見つからない。
どうやら、警察がアメリカの“証人保護プログラム”に似た個人情報の書き換えをおこなったからなのではないか。悠二はそれを主導したのが、今は亡き元官房長・小野田公顕（岸部一徳）ではないかと踏んでいた。
ちょうどそのころ、亡き小野田官房長による一億円の使途不明金事件が明るみになった。まさに智三の行方がわからなくなった時期と同じころだ。事件が事実なら、小野田のことなので何か必要なことに使ったに違いないという右京（水谷豊）。
真相を突き止めるため、康次郎は同じ拘置所内で拘留中の元衆議院議員・瀬戸内米蔵（津川雅彦）に接触する。瀬戸内が小野田と昵懇だったのは下調べ済みだ。
看守らを巻き込み瀬戸内を巧みに強請る真一。瀬戸内は、右京に連絡を取り、智三の行方を探る事を依頼する。ただ、別人になっている智三をどうやって探せばいいのか。米沢（六角精児）らの協力を得て、右京と享（成宮寛貴）は雲をつかむような捜査に臨むのだが…。
果たして右京と享は智三を見つけ出すことができるのか？！
第1話 2013年7月16日「ビリーバー」
第2話 2013年10月23日「殺人の定理」
第3話 2013年10月30日「原因菌」
第4話 2013年11月6日「別れのダンス」
第5話 2013年11月13日「エントリーシート」
第6話 2013年11月20日「右京の腕時計」
第7話 2013年11月27日「目撃証言」
第8話 2013年12月4日「最後の淑女」
第9話 2013年12月11日「かもめが死んだ日」
第10話 2014年1月1日 テレビ朝日開局５５周年記念 元日スペシャル「ボマー〜狙撃容疑者特命係・甲斐享を射殺せよ！」
第11話 2014年1月8日「デイドリーム」
第12話 2014年1月15日「崖っぷちの女」
第13話 2014年1月22日「右京さんの友達」
第14話 2014年2月5日「顔」
第15話 2014年2月12日「見知らぬ共犯者」
第16話 2014年2月19日「聞きすぎた男」
第17話 2014年3月5日「ヒーロー」
第18話 2014年3月12日「待ちぼうけ」
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