航太（松田翔太）たち海診丸のスタッフは伊久島を訪れる。が、その矢先、眞子（武井咲）が風邪をひいて寝込んでしまう。事務長の日内（荒川良々）から看病担当を命じられた航太が眞子を診察していると、そこに昇（福士蒼汰）がやってきた。診察のようすを、ふたりがキスをしていると勘違いした昇は、大きなショックを受け、葵（藤原紀香）にそのことを打ち明ける。
すっかり勘違いした昇のもとに、学生時代のバイト仲間だった白井亜希（佐々木希）が訪問してくる。いつものようにひと目ぼれしてしまう航太を思わずスリッパではたいてしまった昇は、仕事終わりに連絡すると亜希に告げると、航太を引っ張って往診に出かける。
往診を終えた航太は、早く亜希に連絡を取るようにと昇を急かした。が、亜希には３年以上付き合っている婚約者が本土にいることを昇に教えられ、がっかりしながら海診丸へひとり戻る。
海診丸では亜希の妹・美和（吉田里琴）が待っていた。美和は、かつて昇と亜希は両思いの仲だったが昇が告白しなかったために付き合うまでに至らなかったこと、昇が言っていた彼氏がいるという情報は過去のものであることを航太に打ち明けると、最近、亜希はまた昇のことが気になっているようすだから、今度こそ昇がちゃんと告白するように航太からも後押ししてほしい、と頼む。
一方そのころ、昇が眞子に告白するまでもなく失恋してしまったことを知った亜希は、好きな人には言葉にして気持ちを伝えないと、と告げるが…。
第1話 2013年10月14日「瀬戸内海の美しい島々を巡る病院船の物語が今始まる」
第2話 2013年10月21日「ちいさな島の小学校・たった１人の生徒と先生の絆」
第3話 2013年10月28日「瀬戸の花嫁」
第4話 2013年11月4日「美人研修医は超ワガママお嬢様！？」
第5話 2013年11月11日「みかんがつなぐ家族の絆」
第6話 2013年11月18日「元ヤン介護士、離島介護に懸ける夢」
第7話 2013年11月25日「謎の女ついに登場！海診丸最大の危機」
第9話 2013年12月9日
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