犯罪者として逃亡生活を送る二人は、現在と未来から現れる敵に、いつ襲われるか分からないのだ…。差し迫る“審判の日”の到来を阻止し、ジョンの運命を変えようとするサラ。人類の救世主になるさだめを自覚し始めるジョン。恐れを知らない美少女サイボーグのキャメロン（サマー・グロー、『ファイアーフライ宇宙大戦争』）。そして、新しいキャラクターも登場する。ジョンの生活に自由の風を吹き込むが、危険をもたらす存在でもある友人ライリー（レヴェン・ランビン）だ。
セカンド・シーズンでは、サラは未来を救うために孤独な戦いを続け、ジョンは、キャメロンとライリーの間で板挟みとなる。
サラとジョンに困難が立ちはだかり、現在と未来が融合していくにつれて、親子の絆は強くなっていく。だが、彼らがスカイネットに見つかるまで、どれくらいの時間が残されているのだろうか？ ジョンの伯父、デレク・リース（ブライアン・オースティン・グリーン）の登場は、二人の絆と闘いにどんな影響を及ぼすのか？ そして、デレクは“現在”に長居してしまったのか？
一方、クロマティ（ギャレット・ディラハント）の報復をまぬがれたエリソン捜査官（リチャード・Ｔ・ジョーンズ）は、サラの話を信じるようになり、真実の解明に必死になる。そしてエリソンの前に、その真実の鍵を握る人物、ゼイラ社の最高経営責任者であるキャサリン・ウィーバー（シャーリー・マンソン）が現れる。
セカンド・シーズンの初回では、16歳の誕生日を“ジープの爆発”という衝撃的な出来事で迎えたジョンが、自分の運命に一人で立ち向かっていく。一方、エリソン捜査官は、クロマティによる虐殺を目の当たりにして、ＦＢＩ捜査官としての信念が崩れていく。
オリジナル放映日（U.S.)：2008年9月8日
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『ターミネーター：サラ・コナー クロニクルズ 第10話「ジョン抹殺」』の上へ
